云南农业大学机电工程学院创建于1972年，原为农机系，1993年更名为工程技术学院，2014年更名为机电工程学院。
学院拥有农业工程一级学科硕土点，设有农业机械化工程、农业电气化与自动化、农业生物环境与能源工程和机械设计与制造4个二级学科硕士点（学术学位）以及农业工程与信息技术（专业学位）硕士点。学院现设六个系：农业机械工程系、机械工程系、电气工程系、工业工程系、车辆工程系和能源与动力工程系；学院有农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化、工业工程、车辆工程、能源与动力工程和机械电子工程七个本科专业，其中：农业机械化及其自动化和机械设计制造及其自动化专业入选省级一流专业建设计划，农业机械化及其自动化专业为省级特色专业并列为国家级、省级卓越工程师培养计划专业，机械设计制造及其自动化专业为省级卓越工程师培养计划专业；《农业机械学》、《汽车构造》和《拖拉机汽车学》等课程为省级精品课程和省级双语示范课程。学院拥有机电工程实验教学中心（下设32个专业实验室）、机械制造实训中心、农业机械陈列馆和机械设计研究所等实验实践教学机构。此外，学院实践教学可利用学校的基础实验教学中心、工科专业基础实验教学中心等校级实验中心，在校外建立了14个实践教学基地。
学院现有教师64人，其中正高级职称9人、博士学位13人，云南省万人计划“产业技术领军人才1人，云南省技术创新人才2人，云南省高校教师讲课比赛特等奖1人。教师共主持国家级自然科学基金6项，云南省科技厅基金项目25项，教育厅科学研究基金40余项，服务于云南省农业、机械行业等横向课题60余项。教师在《Energy》、《Biosystems Engineering》、《Transactions of the ASABE》、《农业工程学报》、《农业机械学报》等国内外核心期刊上发表论文400多篇，其中50多篇被SCI、EI、CPCI收录；获国家专利授权100多项。教师获得云南省技术发明一等奖（排名第一）1项、云南省自然科学奖三等奖（排名第一）1项等7项省部级科研奖励。
学院现有在校本科生1668人，研究生86人。学院始终把人才培养作为第一要务，注重学生动手能力和创新能力的培养，加强学生校内外实习、实验和生产实践，支持和鼓励学生参与教师科研项目，参加全国和全省各种竞赛，毕业生广受用人单位好评，就业好。