中国农业大学兽医学科是我国高等院校中最早成立的兽医学科之一，动物医学院也是中国农业大学历史最为悠久的学院之一，有着悠久历史和深厚积淀，最早可追溯至京师大学堂创办时期，1902年颁布的《钦定京师大学堂章程》中书有“农业科之目四，一曰农艺学、二曰农业化学、三曰林学、四曰兽医学”的规定，1903年《奏定大学堂章程》第六节农科大学的各科课程中记载有兽医学门科目的详细课程设置。
动物医学院的历史足迹始终伴随着中国农业大学的发展，从京师大学堂农科1914年改名为北京农业专科学校，到1923年改名为国立北平农科大学，再至1928年改为北平大学农学院，各时期的中国农业大学前身都设有兽医学课程；1947年北方大学农学院在晋冀豫成立，设有畜牧兽医系和兽医专科学校，1948年7月北方大学农学院改名为华北大学农学院；1949年10月9日由熊大仕先生创建的北京农业大学兽医系在北京大学农学院、清华大学农学院和华北大学农学院合并后正式诞生，1984年成立兽医学院，1993年更名为动物医学院。
动物医学院几遇变迁，历经坎坷，逐渐发展、壮大起来，特别是兽医系成立之后，处处体现了党在各个时期的领导和关怀，始终浸透着老一辈科学家对兽医事业发展所做出的毕生努力以及广大教育工作者的智慧和力量。熊大仕教授、孔繁瑶教授、李宝仁教授、蒋金书教授、张中直教授、汪明教授曾先后担任系主任或院长，张鹤宇、王洪章、罗仲愚、吴学聪、王树信、申葆和、于船等饮誉海内外的著名教授先后在这里执教。
回顾历史，我们清醒地看到，随着社会的发展、进步，人们对兽医教育的认识有了很大的提高，兽医的重要作用也越来越凸现出来，我们将秉承“同一个世界、同一个健康”的理念，肩负着“发展兽医科技、保障人类健康”的院训，继续努力奋斗。