中山大学农学教育具有悠久的办学历史。1924年，孙中山先生在创建“国立广东大学”之初，就成立了“农科学院”，1926年更名为“国立中山大学农科学院”。著名农学家丁颖教授、邓植仪教授、沈鹏飞教授等均曾在中山大学农学院任教，为我国农业研究和教育培养了一大批优秀人才。1952年全国高校院系调整时，农学院从中山大学调出，分别并入华南农学院、华中农业大学。
为适应我国现代农业发展需要，服务于国家乡村振兴战略，保障国家粮食安全和农业可持续发展，中山大学于2018年8月成立农学院，复办整建制农学教育。目前，农学院在广州校区过渡办学，计划2020年或2021年迁驻深圳校区。
农学院以“农稳社稷，粮安天下”为己任，秉持“汇世界精英，育天下英才”的理念，围绕立德树人的人才培养目标和“双一流”建设的战略发展目标，构建以现代生物技术为主体，融合信息技术和工程技术的新农科，打造具有南方现代农业特色的世界一流农学院。