云南大学物理学科始于1933年原省立东陆大学数理系，至今已80余载，自1945年云南大学物理系成立以来，一直坚持“重视数理基础、教学科研结合、培养创新人才”的人才培养特色，为国家培养了大批物理学人才，在学科建设、人才培养、科学研究和服务社会等方面不断取得可喜的成绩，为云南大学基础学科的坚持和发展做出了积极的贡献。

2013年，依托于云南大学悠久的天文学研究历史和云南得天独厚的天文观测条件，云南大学天文学系成立，成为中国高校第5个“天文学系”。与中国科学院云南天文台联合培育天文学学科新优势，使云南大学成为国家天文学研究和人才培养的重要基地。

为加强基础学科高素质人才培养，建设一流学科，2015年，由物理系、天文学系及云南大学物理实验教学中心（云南省实验教学示范中心）合并组建云南大学物理与天文学院。新组建的学院除以上教学单位外，还有云南省粒子天体物理重点实验室、云南天体物理中心、云南大学核技术应用与辐射防护研究所、物理与天文学院数字城市研究中心、物理与天文学院低碳与节能技术研究所、物理与天文学院光电工程技术研发中心、物理与天文学院数字医疗技术中心、物理与天文学院消防技术研究所等科研机构。学院将以“夯实基础，加强应用，开拓创新，办出特色”的思想为指导，进一步加强物理学和天文学高素质创新人才培养，提升物理学和天文学领域基础研究能力和水平，致力于“研究教学型”学院建设。